Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lama1P19137 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lama1P19137 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms