Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb3P09026 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb3P09026 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms