Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc1O88447 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms