Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms