Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdkO55028 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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BckdkO55028 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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