Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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