Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabep1O35551 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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