Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx7F8VPJ6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms