Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700019A02RikA0A087WPV9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700019A02RikA0A087WPV9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700019A02RikA0A087WPV9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700019A02RikA0A087WPV9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms