Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpv2Q9WTR1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms