Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Cldn19Q9ET38 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Cldn19Q9ET38 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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