Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx6Q9ER75 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms