Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stx12Q9ER00 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx12Q9ER00 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms