Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt34Q9D646 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt34Q9D646 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms