Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spns3Q9D232 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms