Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrdQ8K2M3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrdQ8K2M3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms