Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc1Q80VQ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms