Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtn4rl2Q7M6Z0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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