Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms