Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc44a5Q5RJI2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc44a5Q5RJI2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms