Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TchpQ3TVW5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms