Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah2Q06986 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah2Q06986 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.8 ms