Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bop1P97452 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms