Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct3P80318 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cct3P80318 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms