Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms