Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnga1P29974 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga1P29974 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms