Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1aP25118 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1aP25118 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms