Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lama1P19137 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lama1P19137 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms