Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms