Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms