Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Knop1Q9Z2Q2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms