Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hmgn5Q9JL35 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hmgn5Q9JL35 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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