Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx6Q9ER75 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms