Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tsnaxip1Q99P25 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms