Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms