Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lrrc1Q80VQ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lrrc1Q80VQ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc1Q80VQ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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