Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAB4

Cnpy1, Protein canopy homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy1Q4VAB4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnpy1Q4VAB4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnpy1Q4VAB4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms