Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Lmod2Q3UHZ5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod2Q3UHZ5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms