Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brf2Q3UAW9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brf2Q3UAW9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms