Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf9Q07105 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms