Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Xrn1P97789 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Xrn1P97789 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Xrn1P97789 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms