Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmklr1P97468 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms