Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms