Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8444F6XS56 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8444F6XS56 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms