Protein–RNA interactions for Protein: E9PZZ1

Prdm13, PR domain zinc finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm13E9PZZ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdm13E9PZZ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm13E9PZZ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms