Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod3Q9R0E1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms