Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx12Q9ER00 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms