Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtpbp4Q99ME9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms