Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntg1Q925E1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms