Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg9aQ68FE2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9aQ68FE2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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